Diplomová práce se zabývá analýzou vybraných bakteriálních toxinů Clostridium botulinum, 2 toxinu Clostridium perfringens a Clostridium difficile pomocí metod cílené (SRM) a necílené tandemové hmotnostní spektrometrie. U C. botulinum byla ověřena kvalitativní analýza extraktů pomocí cílené hmotnostní spektrometrie s nížší citlivostí, u kmenů s nižší hladinou produkce pak pomocí necílené tandemové hmotnostní spektrometrie a tyto nálezy byly konfrontovány s PCR výsledky jednotlivých kmenů testovacího panelu. Navržení SRM metody pro kvantitativní a kvalitativní hodnocení bylo provedeno u 2 toxinu C. perfringens, kterému předcházelo otestování pilotní analýzy pomocí necílené tandemové hmotové spektrometrie. U C. difficile byl přípraven panel extraktů vybraných kmenů,
na kterém byla provedena kvalitativní analýza pomocí necílené tandemové hmotnostní spektrometrie pro následný vývoj širší kvalitativní a výhledově kvantitativní analýzy.