Co může prozradit profil mastných kyselin o bakteriích?

Abstract

Chemotaxonomické metody používané v bakteriální systematice pro zisk informací o chemickém složení bakteriálních buněk často využívají analytické postupy. Jednou z nejvíce využívaných metod je analýza mastných kyselin (MK), resp. metylesterů mastných kyselin (FAME, z angl. Fatty Acid Methyl Ester) plynovou chromatografií (GC). Význam této metody pro identifikaci bakterií je založen na strukturálních rozdílech MK jako je délka řetězce, přítomnost nasycených či nenasycených MK, výskyt rozvětvených MK, nebo přítomnost MK s OH skupinou. Spolehlivost a přesnost identifikace bakterií je dána dodržováním standardního operačního postupu při kultivaci bakteriálních buněk i GC analýze. Jedním z velmi dobře propracovaných komerčních systémů pro analýzu bakteriálních MK je Sherlock Microbial Identification Systém (MIS). Jedná se o automatizovaný systém GC, který umožňuje identifikaci celé řady mikroorganismů na základě detekce profilu FAME. Přítomnost různých MK a jejich relativní množství je porovnáno s profily MK referenčních kmenů. Analýza MK plynovou chromatografií je jednoduchou, ekonomicky nenáročnou, a především spolehlivou metodou identifikace.