Digitální knihovna UPCE přechází na novou verzi. Omluvte prosím případné komplikace. / The UPCE Digital Library is migrating to a new version. We apologize for any inconvenience.

Publikace:
Amorphous TiO2 Nanotubes as a Platform for Highly Selective Phosphopeptide Enrichment

Článekopen accesspeer-reviewedpublished version
dc.contributor.authorKupčík, Rudolfcze
dc.contributor.authorMacák, Jancze
dc.contributor.authorŘehulková, Helenacze
dc.contributor.authorSopha, Hanna Ingridcze
dc.contributor.authorFabrik, Ivocze
dc.contributor.authorVeettikkunnu Chandran, Anithacze
dc.contributor.authorKlimentová, Janacze
dc.contributor.authorMurasová, Pavlacze
dc.contributor.authorBílková, Zuzanacze
dc.contributor.authorŘehulka, Pavelcze
dc.date.accessioned2020-03-19T13:02:07Z
dc.date.available2020-03-19T13:02:07Z
dc.date.issued2019eng
dc.description.abstractThis work reports highly selective phosphopeptide enrichment using amorphous TiO2 nanotubes (TiO2NTs) and the same material decorated with superparamagnetic Fe3O4 nanoparticles (TiO2NTs@Fe(3)O(4)NPs). TiO2NTs and TiO2NTs@Fe(3)O(4)NPs materials were applied for phosphopeptide enrichment both from a simple peptide mixture (tryptic digest of bovine serum albumin and alpha-casein) and from a complex peptide mixture (tryptic digest of Jurkat T cell lysate). The obtained enrichment efficiency and selectivity for phosphopeptides of TiO2NTs and TiO2NTs@ Fe(3)O(4)NPs were increased to 28.7 and 25.3%, respectively, as compared to those of the well-established TiO2 microspheres. The enrichment protocol was extended for a second elution step facilitating the identification of additional phosphopeptides. It further turned out that both types of amorphous TiO2 nanotubes provide qualitatively new physicochemical features that are clearly advantageous for highly selective phosphopeptide enrichment. This has been confirmed experimentally resulting in substantial reduction of non-phosphorylated peptides in the enriched samples. In addition, TiO2NTs@Fe(3)O(4)NPs combine high selectivity and ease of handling due to the superparamagnetic character of the material. The presented materials and performances are further promising for applications toward a whole range of other types of biomolecules to be treated in a similar fashion.eng
dc.description.abstract-translatedV práci je představeno vysoce selektivní obohacení fosfopeptidů pomocí amorfních TiO2 nanotrubic (TiO2NTs) stejně jako pomocí stejného materiálu pokrytého superparamagnetickými nanočásticemi Fe3O4 (TiO2NTs@Fe3O4NPs). Oba materiály, TiO2NTs a TiO2NTs@Fe3O4NPs, byly použity pro obohacení fosfopeptidů z jednoduché peptidové směsi (trypticky štěpený hovězí sérový albumin a alfa-kasein) a ze směsi komplexních peptidů (trypticky štěpený lyzát Jurkat T buněk). Získaná účinnost obohacení a selektivita pro fosfopeptidy u materiálů TiO2NT a TiO2NTs@Fe3O4NPs byla zvýšena o 28,7 a 25,3%, ve srovnání se zavedenými mikrokuličkami TiO2. Protokol pro obohacování byl rozšířen o druhý eluční krok usnadňující identifikaci dalších fosfopeptidů. Dále se ukázalo, že oba typy amorfních TiO2 nanotrubic poskytují kvalitativně nové fyzikálně-chemické vlastnosti, které jsou jasně výhodné pro vysoce selektivní obohacení fosfopeptidů. To bylo také experimentálně potvrzeno, což vedlo k podstatnému snížení nefosforylovaných peptidů v obohacených vzorcích. Kromě toho, TiO2NTs@Fe3O4NPs kombinují vysokou selektivitu a snadnou manipulaci díky superparamagnetickému charakteru materiálu. Prezentované materiály a jejich užitná hodnota jsou slibné pro aplikace u celé řady dalších typů biomolekul, které mají být zpracovány podobným způsobem.cze
dc.formatp. 12156-12166eng
dc.identifier.doi10.1021/acsomega.9b00571eng
dc.identifier.issn2470-1343eng
dc.identifier.obd39883553eng
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10195/75002
dc.identifier.wos000482176800096eng
dc.language.isoengeng
dc.peerreviewedyeseng
dc.publicationstatuspublished versioneng
dc.publisherAmerican Chemical Societyeng
dc.relation.ispartofACS Omega, volume 4, issue: 7eng
dc.relation.publisherversionhttps://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.9b00571eng
dc.rightsopen access (ACS AuthorChoice)eng
dc.rights.licencehttps://pubs.acs.org/page/4authors/authorchoice/options.html#
dc.subjectaffinity-chromatographyeng
dc.subjecttitania nanotubeseng
dc.subjectphosphorylationeng
dc.subjectseparationeng
dc.subjectpurificationeng
dc.subjectmicrosphereseng
dc.subjectadsorptioneng
dc.subjecttitanium dioxideeng
dc.subjectlayerseng
dc.subjectidentificationeng
dc.subjectafinitní chromatografiecze
dc.subjecttitanové nanotrubicecze
dc.subjectfosforylacecze
dc.subjectseparacecze
dc.subjectpurifikacecze
dc.subjectmikrosférycze
dc.subjectadsorpcecze
dc.subjectoxid titaničitýcze
dc.subjectvrstvycze
dc.subjectidentifikacecze
dc.titleAmorphous TiO2 Nanotubes as a Platform for Highly Selective Phosphopeptide Enrichmenteng
dc.title.alternativeAmorfní nanotrubičky TiO2 jako platforma pro vysoce selektivní obohacení fosfopeptidůcze
dc.typeArticleeng
dspace.entity.typePublication

Soubory

Původní svazek

Nyní se zobrazuje 1 - 1 z 1
Načítá se...
Náhled
Název:
acsomega.9b00571.pdf
Velikost:
4.93 MB
Formát:
Adobe Portable Document Format