Digitální knihovna UPCE přechází na novou verzi. Omluvte prosím případné komplikace. / The UPCE Digital Library is migrating to a new version. We apologize for any inconvenience.

Publikace:
Identification of Gangliosides in Biological Samples Using Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography – Mass Spectrometry.

ČlánekOmezený přístuppeer-reviewedpublished
dc.contributor.authorHájek, Romancze
dc.contributor.authorJirásko, Robertcze
dc.contributor.authorLísa, Miroslavcze
dc.contributor.authorCífková, Evacze
dc.contributor.authorHolčapek, Michalcze
dc.date.accessioned2018-02-27T03:39:46Z
dc.date.available2018-02-27T03:39:46Z
dc.date.issued2017eng
dc.description.abstractThe hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) coupled to a negative-ion electrospray ionization tandem mass spectrometry (ESI-MS/MS) method has been developed for the identification of a wide range of gangliosides in biological samples. Gangliosides consist of a backbone of sphingoid base and a polar oligosaccharide chain containing at least one sialic acid. Gangliosides are extracted by chloroform-methanol-water mixture, where an upper aqueous layer containing gangliosides and other polar lipid subclasses is further purified by C18 solid-phase extraction. The optimization of chromatographic conditions includes the column selection, mobile-phase composition, pH value, buffer type, and concentration with the goal to achieve the best chromatographic resolution and MS sensitivity. The identification of gangliosides and other polar lipids is based on accurate m/z values of [M-H]- ions and fragment ions as well measured by high-resolution MS. The detailed interpretation of MS/MS spectra enables the generalization of fragmentation pathways, which is then used for the differentiation of a, b, and c series of gangliosides. The structural assignment is further confirmed by agreement with the predicted retention behavior in HILIC mode on the basis of the correlation among the ganglioside retention, the number of saccharide units, and their sequence. The final HILIC/ESI-MS/MS method is applied for the analysis of porcine brain, human kidney, lungs, plasma, and erythrocytes resulting in unambiguous identification of 145 ganglioside species from 19 subclasses, which represents the highest number of reported gangliosides. Moreover, 71 sulfatides and 59 polar phospholipids (phosphatidylserines, phosphatidylinositols, lysophosphatidylinositols, and phosphatidylglycerols) are detected within a 15 min run.eng
dc.description.abstract-translatedPro identifikaci široké škály gangliosidů v biologických vzorcích byla vyvinuta metoda založená na chromatografii hydrofilních interakcí (HILIC) ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií s ionizací elektrosprejem (ESI-MS/MS). Gangliosidy se skládají ze sfingoidové báze a polárního oligosacharidového řetězce obsahujícího alespoň jednu kyselinu sialovou. Gangliosidy se extrahují směsí chloroformu, methanolu a vody, přičemž horní vodná vrstva obsahující gangliosidy a jiné polární lipidové podtřídy se dále čistí extrakcí C18 v pevné fázi. Optimalizace chromatografických podmínek zahrnuje výběr kolony, složení mobilní fáze, hodnotu pH s cílem dosáhnout nejlepšího chromatografického rozlišení a citlivosti na MS. Identifikace gangliosidů a jiných polárních lipidů je založena na přesných m/z hodnotách iontů [M-H] a iontů fragmentů, měřených MS s vysokým rozlišením. Podrobná interpretace spektra MS/MS umožňuje zobecnění fragmentačních cest, které se pak používají pro diferenciaci gangliosidů řady a, b, c. Strukturní zařazení je dále potvrzeno předpokládaným retenčním chováním v režimu HILIC na základě korelace mezi retencí gangliosidů, počtem sacharidových jednotek a jejich sekvencí. Pro analýzu byly použity vzorky prasečího mozku, lidských ledvin, plic, plazmy a erytrocytů. Použitá metoda HILIC/ESI-MS/MS vede k jednoznačné identifikaci 145 druhů gangliosidů z 19 podtříd, což představuje nejvyšší počet zaznamenaných gangliosidů. Kromě toho bylo v průběhu 15 minut zjištěno 71 sulfatidů a 59 polárních fosfolipidů (fosfatidylserinů, fosfatidylinositolů, lysofosfatidylinositolů a fosfatidylglycerolů).cze
dc.formatp. 12425–12432eng
dc.identifier.doi10.1021/acs.analchem.7b03523eng
dc.identifier.issn0003-2700eng
dc.identifier.obd39879213eng
dc.identifier.scopus2-s2.0-85035049109
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10195/70278
dc.identifier.wos000416498100073
dc.language.isoengeng
dc.peerreviewedyeseng
dc.publicationstatuspublishedeng
dc.relation.ispartofAnalytical Chemistry, volume 89, issue: 22eng
dc.rightsPráce není přístupnáeng
dc.subjectGangliosideseng
dc.subjectBiological Sampleseng
dc.subjectHydrophilic Interactioneng
dc.subjectLiquid Chromatographyeng
dc.subjectMass Spectrometry.eng
dc.subjectGangliosidycze
dc.subjectBiologické vzorkycze
dc.subjectHydrofilní interakcecze
dc.subjectKapalinová chromatografiecze
dc.subjectHmotnostní spektrometrie.cze
dc.titleIdentification of Gangliosides in Biological Samples Using Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography – Mass Spectrometry.eng
dc.title.alternativeIdentifikace gangliosidů v biologických vzorcích pomocí kapalinové chromatografie hydrofilních interakcí- hmotnostní spektrometrii.cze
dc.typeArticleeng
dspace.entity.typePublication

Soubory

Původní svazek

Nyní se zobrazuje 1 - 1 z 1
Načítá se...
Náhled
Název:
RE_AnalChem_89_2017_12425_gangliosides.pdf
Velikost:
1.48 MB
Formát:
Adobe Portable Document Format