Analýza proteinů s využitím imobilizovaného Clostripainu a techniky Selected Reaction Monitoring (SRM)

Baronová, Jana

Publikace:
Analýza proteinů s využitím imobilizovaného Clostripainu a techniky Selected Reaction Monitoring (SRM)

Diplomová práceOmezený přístup

dc.contributor.advisor	Jankovičová, Barbora	cze
dc.contributor.author	Baronová, Jana
dc.date.accepted	2013	cze
dc.date.accessioned	2014-01-08T09:06:58Z
dc.date.available	2014-01-08T09:06:58Z
dc.date.issued	2013
dc.description.abstract	Diplomová práce se zabývá imobilizací proteolytického enzymu Clostripainu na vhodný magnetický nosič a jeho následnou aplikací pro štěpení proteinů v rámci hmotnostně-spektrometrické techniky monitorování vybraných reakcí (SRM). Testovány byly různé magnetické částice lišící se velikostí, porozitou či funkčními skupinami na svém povrchu. Na základě stanovení aktivity byly pro následné štěpení vybrány nosiče, na které bylo navázáno nejvíce enzymu. Pro štěpení byly zvoleny sérový bovinní albumin jako modelový protein a ricin jako konkrétní proteinový toxin. Štěpení bylo pro srovnání prováděno také trypsinem a oba enzymy byly testovány jak v solubilní tak imobilizované formě. Výsledné peptidové fragmenty byly analyzovány pomocí SDS-PAGE a následně byly kvantifikovány pomocí hmotnostního analyzátoru 4000 QTRAP.	cze
dc.description.abstract-translated	This thesis deals with the immobilization of proteolytic enzyme Clostripain onto suitable magnetic carrier and its subsequent application for digestion of proteins in the frame of mass-spectrometric technique selected reaction monitoring (SRM). Various magnetic beads differing in size, porosity or surface functional groups were tested. Carriers with the highest amount of bound enzyme were selected for subsequent cleavage based on the determination of immobilized enzymes activity. Bovine serum albumin as a model protein and ricin as a specific protein toxin were chosen for cleavage. For comparison cleavage was also performed with trypsin and both enzymes were tested in soluble and immobilized form. The final peptide fragments were analyzed by SDS-PAGE and subsequently quantified by the mass analyzer 4000 QTRAP.	eng
dc.description.defence	1. Prezentace výsledků diplomové práce 2. Diskuze k posudkům vedoucího a oponenta diplomové práce 3. Diplomantka zodpověděla všechny dotazy a připomínky k DP	cze
dc.description.department	Katedra biologických a biochemických věd	cze
dc.description.grade	Dokončená práce s úspěšnou obhajobou	cze
dc.format	108 s.	cze
dc.format.extent	2596955 bytes	cze
dc.format.mimetype	application/pdf	cze
dc.identifier	Univerzitní knihovna (studovna)	cze
dc.identifier.signature	D30285	cze
dc.identifier.stag	20473	cze
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/10195/54075
dc.language.iso	cze
dc.publisher	Univerzita Pardubice	cze
dc.rights	Pouze v rámci univerzity	cze
dc.subject	SRM technika	cze
dc.subject	magnetické částice	cze
dc.subject	Clostripain	cze
dc.subject	magnetic beads	eng
dc.subject	immobilization	eng
dc.subject	proteolysis	eng
dc.subject	SRM technique	eng
dc.subject	ricin	cze
dc.subject	imobilizace	cze
dc.subject	proteolýza	cze
dc.thesis.degree-discipline	Analýza biologických materiálů	cze
dc.thesis.degree-grantor	Univerzita Pardubice. Fakulta chemicko-technologická	cze
dc.thesis.degree-name	Mgr.	cze
dc.thesis.degree-program	Speciální chemicko-biologické obory	cze
dc.title	Analýza proteinů s využitím imobilizovaného Clostripainu a techniky Selected Reaction Monitoring (SRM)	cze
dc.title.alternative	Protein analysis using immobilized Clostripain and Selected Reaction Monitoring (SRM) technique	eng
dc.type	diplomová práce	cze
dspace.entity.type	Publication