Digitální knihovna UPCE přechází na novou verzi. Omluvte prosím případné komplikace. / The UPCE Digital Library is migrating to a new version. We apologize for any inconvenience.

Publikace:
HILIC/MS quantitation of low-abundant phospholipids and sphingolipids in human plasma and serum: Dysregulation in pancreatic cancer

ČlánekOmezený přístuppeer-reviewedpostprint
dc.contributor.authorPeterka, Ondřejcze
dc.contributor.authorMaccelli, Alessandrocze
dc.contributor.authorJirásko, Robertcze
dc.contributor.authorLásko, Zuzanacze
dc.contributor.authorIdkowiak, Jakubcze
dc.contributor.authorHrstka, Romancze
dc.contributor.authorWolrab, Denisecze
dc.contributor.authorHolčapek, Michalcze
dc.date.accessioned2025-10-07T10:34:00Z
dc.date.issued2024eng
dc.description.abstractA new hydrophilic interaction liquid chromatography - mass spectrometry method is developed for low-abundant phospholipids and sphingolipids in human plasma and serum. The optimized method involves the Cogent Silica type C hydride column, the simple sample preparation by protein precipitation, and the removal of highly abundant lipid classes using the postcolumn valve directed to waste during two elution windows. The method allows a highly confident and sensitive identification of low-abundant lipid classes in human plasma (246 lipid species from 24 lipid subclasses) based on mass accuracy and retention dependencies in both polarity modes. The method is validated for quantitation using two internal standards (if available) for each lipid class and applied to human plasma and serum samples obtained from patients with pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), healthy controls, and NIST SRM 1950. Multivariate data analysis followed by various statistical projection methods is used to determine the most dysregulated lipids. Significant downregulation is observed for lysophospholipids with fatty acyl composition 16:0, 18:0, 18:1, and 18:2. Distinct trends are observed for phosphatidylethanolamines (PE) in relation to the bonding type of fatty acyls, where most PE with acyl bonds are upregulated, while ether/plasmenyl PE are downregulated. For the sphingolipid category, sphingolipids with very long N-acyl chains are downregulated, while sphingolipids with shorter N-acyl chains were upregulated in PDAC. These changes are consistently observed for various classes of sphingolipids, ranging from ceramides to glycosphingolipids, indicating a possible metabolic disorder in ceramide biosynthesis caused by PDAC.eng
dc.description.abstract-translatedByla vyvinuta nová metoda kapalinové chromatografie s hydrofilní interakcí ve spojení s hmotnostní spektrometrií (HILIC/MS) pro nízko zastoupené fosfolipidy a sfingolipidy v lidské plazmě a séru. Optimalizovaná metoda zahrnuje použití kolony Cogent Silica typu C hydride, jednoduchou přípravu vzorků pomocí precipitace proteinů a odstranění vysoce zastoupených lipidových tříd pomocí postkolonového ventilu směřujícího odpad během dvou eluačních oken. Metoda umožňuje vysoce spolehlivou a citlivou identifikaci nízko zastoupených lipidových tříd v lidské plazmě (246 lipidových druhů z 24 lipidových podtříd) na základě přesnosti hmoty a závislostí retence v obou polaritních režimech. Kvantifikace byla validována pomocí dvou interních standardů (pokud jsou k dispozici) pro každou lipidovou třídu a aplikována na vzorky plazmy a séra získané od pacientů s duktálním adenokarcinomem slinivky (PDAC), zdravých kontrol a vzorků NIST SRM 1950. Multivariační analýza dat, následovaná různými statistickými projekčními metodami, byla použita k určení nejvíce dysregulovaných lipidů. Významné snížení bylo pozorováno u lysofosfolipidů s mastnými kyselinami o složení 16:0, 18:0, 18:1 a 18:2. U fosfatidylethanolaminů (PE) byly zaznamenány odlišné trendy v závislosti na typu vazby mastných kyselin: většina PE s acylovými vazbami byla zvýšena, zatímco etherové/plasmenylové PE byly sníženy. V kategorii sfingolipidů byly sfingolipidy s velmi dlouhými N-acylovými řetězci sníženy, zatímco sfingolipidy s kratšími N-acylovými řetězci byly zvýšeny u PDAC. Tyto změny byly konzistentně pozorovány u různých tříd sfingolipidů, od ceramidů po glycosfingolipidy, což naznačuje možnou metabolickou poruchu v biosyntéze ceramidů způsobenou PDAC.cze
dc.formatp. 342144eng
dc.identifier.doi10.1016/j.aca.2023.342144eng
dc.identifier.issn0003-2670eng
dc.identifier.obd39890511eng
dc.identifier.scopus2-s2.0-85181142328eng
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10195/86138
dc.identifier.wos001165649800001eng
dc.language.isoengeng
dc.peerreviewedyeseng
dc.publicationstatuspostprinteng
dc.relation.ispartofAnalytica Chimica Acta, volume 1288, issue: February 2024eng
dc.relation.publisherversionhttps://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S000326702301365X?via%3Dihubeng
dc.rightsPráce není přístupnáeng
dc.subjectHILIC/MSeng
dc.subjectPhospholipidseng
dc.subjectSphingolipidseng
dc.subjectHuman plasma and serumeng
dc.subjectPancreatic cancereng
dc.subjectHILIC/MScze
dc.subjectfosfolipidycze
dc.subjectsfingolipidycze
dc.subjectLidská plazma a sérumcze
dc.subjectRakovina slinivky břišnícze
dc.titleHILIC/MS quantitation of low-abundant phospholipids and sphingolipids in human plasma and serum: Dysregulation in pancreatic cancereng
dc.title.alternativeHILIC/MS kvantifikace zastoupených fosfolipidů a sfingolipidů v lidské plazmě a séru: Dysregulace při rakovině slinivky břišní.cze
dc.typearticleeng
dspace.entity.typePublication

Soubory

Původní svazek

Nyní se zobrazuje 1 - 1 z 1
Načítá se...
Náhled
Název:
1-s2.0-S000326702301365X-main.pdf
Velikost:
5.91 MB
Formát:
Adobe Portable Document Format