Phenol/Chloroform-Free TiO2-Based miRNA Extraction from Cell Lysate

Show simple item record

dc.contributor.author Smělá, Denisa
dc.contributor.author Zelinková, Eliška
dc.contributor.author Řehulka, Pavel
dc.contributor.author Bílková, Zuzana
dc.contributor.author Kupčík, Rudolf
dc.date.accessioned 2023-07-12T12:59:38Z
dc.date.available 2023-07-12T12:59:38Z
dc.date.issued 2022
dc.identifier.issn 1661-6596
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/10195/81014
dc.description.abstract While microRNAs are considered as excellent biomarkers of various diseases, there are still several remaining challenges regarding their isolation. In this study, we aimed to design a novel RNA isolation method that would help to overcome those challenges. Therefore, we present a novel phenol/chloroform-free, low-cost method for miRNA extraction. Within this method, RNA is extracted from cell lysate with an isopropanol/water/NaCl system, followed by solid-phase extraction using TiO2 microspheres to effectively separate short RNAs from long RNA molecules. We also demonstrated the pH-dependent selectivity of TiO2 microspheres towards different sizes of RNA. We were able to regulate the size range of extracted RNAs with simple adjustments in binding conditions used during the solid-phase extraction. eng
dc.format p. 8848 eng
dc.language.iso eng
dc.publisher MDPI eng
dc.relation.ispartof International Journal of Molecular Sciences, volume 23, issue: 16 eng
dc.rights open access eng
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subject miRNA isolation eng
dc.subject TiO2 eng
dc.subject phenol/chloroform-free eng
dc.subject short RNA extraction eng
dc.subject miRNA izolace cze
dc.subject TiO2 cze
dc.subject extrakce krátkých RNA cze
dc.title Phenol/Chloroform-Free TiO2-Based miRNA Extraction from Cell Lysate eng
dc.title.alternative Extrakce miRNA z buněčného lyzátu bez fenol/chloroformu s využitím nosiče na bázi TiO2 cze
dc.type article eng
dc.description.abstract-translated Ačkoliv jsou microRNA považovány za excelentní biomarkery pro řadu onemocnění, jejich izolace má stále řadu limitací. V této studii jsme se zaměřili na vývoj nové metody izolace RNA, která by některé z těchto limitů pomohla překonat. V této práce je uvedena nová, ekonomicky dostupná metoda izolace RNA, která nevyužívá systému fenol/chloroform. RNA je extrahována z buněčného lyzátu pomocí systému isopropanol/voda/NaCl, který je následován extrakcí na pevnou fázi s využitím TiO2 mikrosfér. Je zde také popsán vliv pH na selektivitu TiO2 mikrosfér k různým velikostem RNA molekul. Pomocí úpravy vazebných podmínek je možné regulovat, jaké rozmezí velikostí RNA molekul bude během extrakce na pevnou fázi ze vzorku izolováno. cze
dc.peerreviewed yes eng
dc.publicationstatus published eng
dc.identifier.doi 10.3390/ijms23168848
dc.relation.publisherversion https://www.mdpi.com/1422-0067/23/16/8848
dc.rights.licence CC BY 4.0
dc.project.ID EF17_048/0007421/NANOBIO - posilování mezioborové spolupráce ve výzkumu nanomateriálů a při studiu jejich účinků na živé organismy cze
dc.identifier.wos 000845731600001
dc.identifier.scopus 2-s2.0-85137739076
dc.identifier.obd 39887629


This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

open access Except where otherwise noted, this item's license is described as open access

Search DSpace


Advanced Search

Browse

My Account