Lipidomic and metabolomic analysis reveals changes in biochemical pathways for non-small cell lung cancer tissues

Zobrazit minimální záznam

dc.contributor.author Cífková, Eva
dc.contributor.author Brumarová, Radana
dc.contributor.author Ovčačíková, Magdaléna
dc.contributor.author Dobešová, Dana
dc.contributor.author Mičová, Kateřina
dc.contributor.author Kvasnička, Aleš
dc.contributor.author Vaňková, Zuzana
dc.contributor.author Šiller, Jiří
dc.contributor.author Sákra, Lukáš
dc.contributor.author Friedecký, David
dc.contributor.author Holčapek, Michal
dc.date.accessioned 2023-07-12T12:54:12Z
dc.date.available 2023-07-12T12:54:12Z
dc.date.issued 2022
dc.identifier.issn 1388-1981
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/10195/80938
dc.description.abstract Lung cancer represents one of the leading worldwide causes of cancer death, but the pathobiochemistry of this disease is still not fully understood. Here we characterize the lipidomic and metabolomic profiles of the tumor and surrounding normal tissues for 23 patients with non-small cell lung cancer. In total, 500 molecular species were identified and quantified by a combination of the lipidomic shotgun tandem mass spectrometry (MS/MS) analysis and the targeted metabolomic approach using liquid chromatography (LC) – MS/MS. The statistical evaluation includes multivariate and univariate methods with the emphasis on paired statistical approaches. Our research revealed significant changes in several biochemical pathways related to the central carbon metabolism, acylcarnitines, dipeptides as well as the disruption in the lipid metabolism observed mainly for glycer- ophospholipids, sphingolipids, and cholesteryl esters. eng
dc.format p. 159082 eng
dc.language.iso eng
dc.relation.ispartof Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids, volume 1867, issue: 2 eng
dc.rights pouze v rámci univerzity cze
dc.subject lung cancer eng
dc.subject lipidomics eng
dc.subject metabolomics eng
dc.subject mass spectrometry eng
dc.subject metabolism eng
dc.subject rakovina plic cze
dc.subject lipidomika cze
dc.subject metabolomika cze
dc.subject hmotnostní spektrometrie cze
dc.subject metabolismus cze
dc.title Lipidomic and metabolomic analysis reveals changes in biochemical pathways for non-small cell lung cancer tissues eng
dc.title.alternative Lipidomická a metabolomická analýza odhaluje změny v biochemických drahách nemalobuněčných plicních nádorových tkání cze
dc.type article eng
dc.description.abstract-translated Rakovina plic představuje jednu z předních celosvětových příčin úmrtí na rakovinu, ale patobiochemie tohoto onemocnění stále není plně pochopena. Zde charakterizujeme lipidomické a metabolomické profily nádoru a okolních normálních tkání pro 23 pacientů s nemalobuněčným karcinomem plic. Celkem bylo identifikováno a kvantifikováno 500 molekulárních druhů kombinací shotgun lipidomické tandemové hmotnostní spektrometrie (MS/MS) a cíleného metabolomického přístupu s využitím kapalinové chromatografie (LC) – MS/MS. Statistické hodnocení zahrnuje vícerozměrné a jednorozměrné metody s důrazem na párové statistické přístupy. Náš výzkum odhalil významné změny v několika biochemických drahách souvisejících s centrálním metabolismem uhlíku, acylkarnity, dipeptidy, stejně jako narušení metabolismu lipidů pozorované hlavně u glykofosfolipidů, sfingolipidů a cholesterylesterů. cze
dc.peerreviewed yes eng
dc.publicationstatus published eng
dc.identifier.doi 10.1016/j.bbalip.2021.159082
dc.relation.publisherversion https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1388198121002109
dc.identifier.wos 000729063500006
dc.identifier.scopus 2-s2.0-85120402480
dc.identifier.obd 39886273


Tento záznam se objevuje v následujících kolekcích

Zobrazit minimální záznam

Vyhledávání


Rozšířené hledání

Procházet

Můj účet