Quality control requirements for the correct annotation of lipidomics data

Zobrazit minimální záznam

dc.contributor.author Koefeler, Harald C
dc.contributor.author Eichmann, Thomas O
dc.contributor.author Ahrends, Robert
dc.contributor.author Bowden, John A
dc.contributor.author Danne-Rasche, Niklas
dc.contributor.author Dennis, Edward A
dc.contributor.author Fedorova, Maria
dc.contributor.author Griffiths, William J
dc.contributor.author Han, Xianlin
dc.contributor.author Hartler, Juergen
dc.contributor.author Holčapek, Michal
dc.contributor.author Jirásko, Robert
dc.contributor.author Koelmel, Jeremy P
dc.contributor.author Ejsing, Christer S
dc.contributor.author Liebisch, Gerhard
dc.contributor.author Ni, Zhixu
dc.contributor.author O'Donnell, Valerie B
dc.contributor.author Quehenberger, Oswald
dc.contributor.author Schwudke, Dominik
dc.contributor.author Shevchenko, Andrej
dc.contributor.author Wakelam, Michael J. O
dc.contributor.author Wenk, Markus R
dc.contributor.author Wolrab, Denise
dc.contributor.author Ekroos, Kim
dc.date.accessioned 2022-06-03T12:31:57Z
dc.date.available 2022-06-03T12:31:57Z
dc.date.issued 2021
dc.identifier.issn 2041-1723
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/10195/79340
dc.description.abstract Automated lipid species annotation based on fragment ion mass spectra faces three major challenges; isobaric or isomeric lipid species from different classes often yield similar fragments and cannot be unambigiously matched; the abundance of lipid fragments strongly depends on the experimental conditions which compromises their similarity to reference spectra; fragmentation of co-isolated precursors often originating from different classes yields highly convoluted spectra. eng
dc.format p. 4771 eng
dc.language.iso eng
dc.publisher Nature Publishing Group eng
dc.relation.ispartof Nature Communications, volume 12, issue: 1 eng
dc.rights open access eng
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subject identification eng
dc.subject lipidomics data eng
dc.subject identifikace cze
dc.subject lipidomické údaje cze
dc.title Quality control requirements for the correct annotation of lipidomics data eng
dc.title.alternative Požadavky na kontrolu kvality pro správnou anotaci lipidomických údajů cze
dc.type article eng
dc.description.abstract-translated Automatizovaná anotace lipidů založená na fragmentových iontových hmotnostních spektrech čelí třem hlavním výzvám; izobarické nebo izomerní lipidy z různých tříd často poskytují podobné fragmenty a nelze je jednoznačně porovnat; množství lipidových fragmentů silně závisí na experimentálních podmínkách, které kompromitují jejich podobnost s referenčními spektry; fragmentace spoluizolovaných prekurzorů z různých tříd často poskytuje vysoce spletitá spektra. cze
dc.peerreviewed yes eng
dc.publicationstatus published version eng
dc.identifier.doi 10.1038/s41467-021-24984-y
dc.relation.publisherversion https://www.nature.com/articles/s41467-021-24984-y
dc.rights.licence CC BY 4.0
dc.identifier.wos 000684548700005
dc.identifier.scopus 2-s2.0-85112642644
dc.identifier.obd 39886334


Tento záznam se objevuje v následujících kolekcích

Zobrazit minimální záznam

open access Kromě případů, kde je uvedeno jinak, licence tohoto záznamu je open access

Vyhledávání


Rozšířené hledání

Procházet

Můj účet