Show simple item record
dc.contributor.author |
Peterka, Ondřej
|
cze |
dc.contributor.author |
Jirásko, Robert
|
cze |
dc.contributor.author |
Chocholoušková, Michaela
|
cze |
dc.contributor.author |
Kuchar, Ladislav
|
cze |
dc.contributor.author |
Wolrab, Denise
|
cze |
dc.contributor.author |
Hájek, Roman
|
cze |
dc.contributor.author |
Vrana, David
|
cze |
dc.contributor.author |
Strouhal, Ondrej
|
cze |
dc.contributor.author |
Melichar, Bohuslav
|
cze |
dc.contributor.author |
Holčapek, Michal
|
cze |
dc.date.accessioned |
2021-05-15T18:17:50Z |
|
dc.date.available |
2021-05-15T18:17:50Z |
|
dc.date.issued |
2020 |
eng |
dc.identifier.issn |
1388-1981 |
eng |
dc.identifier.uri |
https://hdl.handle.net/10195/77046 |
|
dc.description.abstract |
Ultrahigh-performance supercritical fluid chromatography - mass spectrometry (UHPSFC/MS), ultrahigh-performance liquid chromatography - mass spectrometry (UHPLC/MS), and matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) - MS techniques were used for the lipidomic characterization of exosomes isolated from human plasma. The high-throughput methods UHPSFC/MS and UHPLC/MS using a silica-based column containing sub-2 mu m particles enabled the lipid class separation and the quantitation based on exogenous class internal standards in < 7 minute run time. MALDI provided the complementary information on anionic lipid classes, such as sulfatides. The nontargeted analysis of 12 healthy volunteers was performed, and absolute molar concentration of 244 lipids in exosomes and 191 lipids in plasma belonging to 10 lipid classes were quantified. The statistical evaluation of data included principal component analysis, orthogonal partial least square discriminant analysis, S-plots, p-values, T-values, fold changes, false discovery rate, box plots, and correlation plots, which resulted in the information on lipid changes in exosomes in comparison to plasma. The major changes were detected in the composition of triacylglycerols, diacylglycerols, phosphatidylcholines, and lysophosphatidylcholines, whereby sphingomyelins, phosphatidylinositols, and sulfatides showed rather similar profiles in both biological matrices. |
eng |
dc.format |
p. 158634 |
eng |
dc.language.iso |
eng |
eng |
dc.publisher |
Elsevier Science BV |
eng |
dc.relation.ispartof |
Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids, volume 1865, issue: 5 |
eng |
dc.rights |
pouze v rámci univerzity |
cze |
dc.subject |
lipidomics |
eng |
dc.subject |
lipids |
eng |
dc.subject |
exosomes |
eng |
dc.subject |
plasma |
eng |
dc.subject |
mass spectrometry |
eng |
dc.subject |
supercritical fluid chromatography |
eng |
dc.subject |
liquid chromatography |
eng |
dc.subject |
lipidomika |
cze |
dc.subject |
lipidy |
cze |
dc.subject |
exosomy |
cze |
dc.subject |
plasma |
cze |
dc.subject |
hmotnosní spektrometrie |
cze |
dc.subject |
superkritická fluidní chromatografie |
cze |
dc.subject |
kapalinová chromatografie |
cze |
dc.title |
Lipidomic characterization of exosomes isolated from human plasma using various mass spectrometry techniques |
eng |
dc.title.alternative |
Lipidomická charakterizace exosomů izolovaných z lidské plazmy pomocí různých technik hmotnostní spektrometrie |
cze |
dc.type |
article |
eng |
dc.description.abstract-translated |
Ultravysokoúčinná superkritická kapalinová chromatografie - hmotnostní spektrometrie (UHPSFC / MS), ultravysokoúčinná kapalinová chromatografie - hmotnostní spektrometrie (UHPLC / MS) a laserová desorpce / ionizace (MALDI) - MS byly použity pro lipidomickou charakterizaci exosomů izolovaných z lidské plazmy. Vysokoúčinné metody UHPSFC / MS a UHPLC / MS využívající kolonu na bázi oxidu křemičitého obsahující částice sub-2 um umožnily separaci lipidové třídy a kvantifikaci na základě interních standardů exogenní třídy v době běhu <7 minut. MALDI poskytl doplňující informace o třídách aniontových lipidů, jako jsou sulfatidy. Byla provedena necílená analýza 12 zdravých dobrovolníků a byla kvantifikována absolutní molární koncentrace 244 lipidů v exosomech a 191 lipidů v plazmě patřících do 10 lipidových tříd. Statistické vyhodnocení dat zahrnovalo analýzu hlavních složek, ortogonální částečnou diskriminační analýzu nejmenších čtverců, S-grafy, p-hodnoty, T-hodnoty, násobné změny, míru falešných objevů, krabicové grafy a korelační grafy, které vyústily v informace o lipidech změny v exosomech ve srovnání s plazmou. Hlavní změny byly detekovány ve složení triacylglycerolů, diacylglycerolů, fosfatidylcholinů a lysofosfatidylcholinů, přičemž sfingomyeliny, fosfatidylinositoly a sulfatidy vykazovaly v obou biologických matricích poměrně podobné profily |
cze |
dc.peerreviewed |
yes |
eng |
dc.publicationstatus |
published version |
eng |
dc.identifier.doi |
10.1016/j.bbalip.2020.158634 |
eng |
dc.relation.publisherversion |
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1388198120300263 |
eng |
dc.identifier.wos |
000520939600003 |
eng |
dc.identifier.scopus |
2-s2.0-85078489204 |
|
dc.identifier.obd |
39884773 |
eng |
This item appears in the following Collection(s)
Show simple item record
|
Search DSpace
Browse
-
All of DSpace
-
This Collection
My Account
|