Zobrazit minimální záznam
dc.contributor.author |
Wolrab, Denise
|
cze |
dc.contributor.author |
Chocholoušková, Michaela
|
cze |
dc.contributor.author |
Jirásko, Robert
|
cze |
dc.contributor.author |
Peterka, Ondřej
|
cze |
dc.contributor.author |
Holčapek, Michal
|
cze |
dc.date.accessioned |
2021-05-15T18:17:45Z |
|
dc.date.available |
2021-05-15T18:17:45Z |
|
dc.date.issued |
2020 |
eng |
dc.identifier.issn |
1618-2642 |
eng |
dc.identifier.uri |
https://hdl.handle.net/10195/77045 |
|
dc.description.abstract |
Ultrahigh-performance supercritical fluid chromatography-mass spectrometry (UHPSFC/MS) has a great potential for the high-throughput lipidomic quantitation of biological samples; therefore, the full optimization and method validation of UHPSFC/MS is compared here with ultrahigh-performance liquid chromatography-mass spectrometry (UHPLC/MS) in hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) mode as the second powerful technique for the lipid class separation. First, the performance of six common extraction protocols is investigated, where the Folch procedure yields the best results with regard to recovery rate, matrix effect, and precision. Then, the full optimization and analytical validation for eight lipid classes using UHPSFC/MS and HILIC-UHPLC/MS methods are performed for the same sample set and applied for the lipidomic characterization of pooled samples of human plasma, human serum, and NIST SRM 1950 human plasma. The choice of appropriate internal standards (IS) for individual lipid classes has a key importance for reliable quantitative workflows illustrated by the selectivity while validation and the calculation of the quantitation error using multiple internal standards per lipid class. Validation results confirm the applicability of both methods, but UHPSFC/MS provides some distinct advantages, such as the successful separation of both non-polar and polar lipid classes unlike to HILIC-UHPLC/MS, shorter total run times (8 vs. 10.5 min), and slightly higher robustness. Various types of correlations between methods (UHPSFC/MS and HILIC-UHPLC/MS), biological material (plasma and serum), IS (laboratory and commercially mixtures), and literature data on the standard reference material show the intra- and inter-laboratory comparison in the quantitation of lipid species from eight lipid classes, the concentration differences in serum and plasma as well as the applicability of non-commercially available internal standard mixtures for lipid quantitation. |
eng |
dc.format |
p. 2375-2388 |
eng |
dc.language.iso |
eng |
eng |
dc.publisher |
Springer |
eng |
dc.relation.ispartof |
Analytical and Bioanalytical Chemistry, volume 412, issue: 10 |
eng |
dc.rights |
pouze v rámci univerzity |
cze |
dc.subject |
supercritical fluid chromatography |
eng |
dc.subject |
hydrophilic interaction liquid chromatography |
eng |
dc.subject |
mass spectrometry |
eng |
dc.subject |
lipidomics |
eng |
dc.subject |
validation |
eng |
dc.subject |
quantitation |
eng |
dc.subject |
plasma |
eng |
dc.subject |
serum |
eng |
dc.subject |
matrix effect |
eng |
dc.subject |
superkritická fluidní chromatografie |
cze |
dc.subject |
kapalinová chromatografie s hydrofilní interakcí |
cze |
dc.subject |
hmotnostní spektrometrie |
cze |
dc.subject |
lipidomika |
cze |
dc.subject |
validace |
cze |
dc.subject |
kvantifikace |
cze |
dc.subject |
plasma |
cze |
dc.subject |
serum |
cze |
dc.subject |
matricový efekt |
cze |
dc.title |
Validation of lipidomic analysis of human plasma and serum by supercritical fluid chromatography-mass spectrometry and hydrophilic interaction liquid chromatography-mass spectrometry |
eng |
dc.title.alternative |
Validace lipidomické analýzy lidské plazmy a séra pomocí superkritické fluidní chromatografie - hmotnostní spektrometrie a kapalinová chromatografie s hydrofilní interakcí - hmotnostní spektrometrie |
cze |
dc.type |
article |
eng |
dc.description.abstract-translated |
Vysokoúčinná superkritická fluidní chromatografie-hmotnostní spektrometrie (UHPSFC / MS) má velký potenciál pro vysokoúčinnou lipidomickou kvantifikaci biologických vzorků; proto je zde úplná optimalizace a validace metody UHPSFC / MS srovnávána s ultravysokoúčinnou kapalinovou chromatografií-hmotnostní spektrometrií (UHPLC / MS) v režimu hydrofilní interakční kapalinové chromatografie (HILIC) jako druhé výkonné techniky pro separaci lipidových tříd. Nejprve se zkoumá účinnost šesti běžných extrakčních protokolů, kde Folchova metoda přináší nejlepší výsledky s ohledem na míru obnovy, maticový efekt a přesnost. Poté se provede úplná optimalizace a analytická validace pro osm lipidových tříd pomocí metod UHPSFC / MS a HILIC-UHPLC / MS pro stejnou sadu vzorků a použije se pro lipidomickou charakterizaci shromážděných vzorků lidské plazmy, lidského séra a NIST SRM 1950 lidská plazma. Volba vhodných interních standardů (IS) pro jednotlivé lipidové třídy má klíčový význam pro spolehlivé kvantitativní pracovní toky ilustrované selektivitou při validaci a výpočtem kvantifikační chyby s použitím více interních standardů na lipidovou třídu. Výsledky validace potvrzují použitelnost obou metod, ale UHPSFC / MS poskytuje některé výrazné výhody, jako je úspěšná separace nepolárních a polárních lipidových tříd na rozdíl od HILIC-UHPLC / MS, kratší celkové doby běhu (8 vs. 10,5 min ) a mírně vyšší robustnost. Různé typy korelací mezi metodami (UHPSFC / MS a HILIC-UHPLC / MS), biologickým materiálem (plazma a sérum), IS (laboratorní a komerčně dostupné směsi) a literárními údaji o standardním referenčním materiálu ukazují intra- a mezilaboratorní srovnání v kvantifikaci lipidových druhů z osmi lipidových tříd, rozdíly v koncentraci v séru a plazmě, jakož i použitelnost nekomerčně dostupných směsí vnitřních standardů pro kvantifikaci lipidů. |
cze |
dc.peerreviewed |
yes |
eng |
dc.publicationstatus |
published version |
eng |
dc.identifier.doi |
10.1007/s00216-020-02473-3 |
eng |
dc.relation.publisherversion |
https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/s00216-020-02473-3.pdf |
eng |
dc.identifier.wos |
000518160200002 |
eng |
dc.identifier.obd |
39884771 |
eng |
Tento záznam se objevuje v následujících kolekcích
Zobrazit minimální záznam
|
Vyhledávání
Procházet
-
Vše v Digitální knihovně
-
Tato kolekce
Můj účet
|