Validation of lipidomic analysis of human plasma and serum by supercritical fluid chromatography-mass spectrometry and hydrophilic interaction liquid chromatography-mass spectrometry

Zobrazit minimální záznam

dc.contributor.author Wolrab, Denise cze
dc.contributor.author Chocholoušková, Michaela cze
dc.contributor.author Jirásko, Robert cze
dc.contributor.author Peterka, Ondřej cze
dc.contributor.author Holčapek, Michal cze
dc.date.accessioned 2021-05-15T18:17:45Z
dc.date.available 2021-05-15T18:17:45Z
dc.date.issued 2020 eng
dc.identifier.issn 1618-2642 eng
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/10195/77045
dc.description.abstract Ultrahigh-performance supercritical fluid chromatography-mass spectrometry (UHPSFC/MS) has a great potential for the high-throughput lipidomic quantitation of biological samples; therefore, the full optimization and method validation of UHPSFC/MS is compared here with ultrahigh-performance liquid chromatography-mass spectrometry (UHPLC/MS) in hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) mode as the second powerful technique for the lipid class separation. First, the performance of six common extraction protocols is investigated, where the Folch procedure yields the best results with regard to recovery rate, matrix effect, and precision. Then, the full optimization and analytical validation for eight lipid classes using UHPSFC/MS and HILIC-UHPLC/MS methods are performed for the same sample set and applied for the lipidomic characterization of pooled samples of human plasma, human serum, and NIST SRM 1950 human plasma. The choice of appropriate internal standards (IS) for individual lipid classes has a key importance for reliable quantitative workflows illustrated by the selectivity while validation and the calculation of the quantitation error using multiple internal standards per lipid class. Validation results confirm the applicability of both methods, but UHPSFC/MS provides some distinct advantages, such as the successful separation of both non-polar and polar lipid classes unlike to HILIC-UHPLC/MS, shorter total run times (8 vs. 10.5 min), and slightly higher robustness. Various types of correlations between methods (UHPSFC/MS and HILIC-UHPLC/MS), biological material (plasma and serum), IS (laboratory and commercially mixtures), and literature data on the standard reference material show the intra- and inter-laboratory comparison in the quantitation of lipid species from eight lipid classes, the concentration differences in serum and plasma as well as the applicability of non-commercially available internal standard mixtures for lipid quantitation. eng
dc.format p. 2375-2388 eng
dc.language.iso eng eng
dc.publisher Springer eng
dc.relation.ispartof Analytical and Bioanalytical Chemistry, volume 412, issue: 10 eng
dc.rights pouze v rámci univerzity cze
dc.subject supercritical fluid chromatography eng
dc.subject hydrophilic interaction liquid chromatography eng
dc.subject mass spectrometry eng
dc.subject lipidomics eng
dc.subject validation eng
dc.subject quantitation eng
dc.subject plasma eng
dc.subject serum eng
dc.subject matrix effect eng
dc.subject superkritická fluidní chromatografie cze
dc.subject kapalinová chromatografie s hydrofilní interakcí cze
dc.subject hmotnostní spektrometrie cze
dc.subject lipidomika cze
dc.subject validace cze
dc.subject kvantifikace cze
dc.subject plasma cze
dc.subject serum cze
dc.subject matricový efekt cze
dc.title Validation of lipidomic analysis of human plasma and serum by supercritical fluid chromatography-mass spectrometry and hydrophilic interaction liquid chromatography-mass spectrometry eng
dc.title.alternative Validace lipidomické analýzy lidské plazmy a séra pomocí superkritické fluidní chromatografie - hmotnostní spektrometrie a kapalinová chromatografie s hydrofilní interakcí - hmotnostní spektrometrie cze
dc.type article eng
dc.description.abstract-translated Vysokoúčinná superkritická fluidní chromatografie-hmotnostní spektrometrie (UHPSFC / MS) má velký potenciál pro vysokoúčinnou lipidomickou kvantifikaci biologických vzorků; proto je zde úplná optimalizace a validace metody UHPSFC / MS srovnávána s ultravysokoúčinnou kapalinovou chromatografií-hmotnostní spektrometrií (UHPLC / MS) v režimu hydrofilní interakční kapalinové chromatografie (HILIC) jako druhé výkonné techniky pro separaci lipidových tříd. Nejprve se zkoumá účinnost šesti běžných extrakčních protokolů, kde Folchova metoda přináší nejlepší výsledky s ohledem na míru obnovy, maticový efekt a přesnost. Poté se provede úplná optimalizace a analytická validace pro osm lipidových tříd pomocí metod UHPSFC / MS a HILIC-UHPLC / MS pro stejnou sadu vzorků a použije se pro lipidomickou charakterizaci shromážděných vzorků lidské plazmy, lidského séra a NIST SRM 1950 lidská plazma. Volba vhodných interních standardů (IS) pro jednotlivé lipidové třídy má klíčový význam pro spolehlivé kvantitativní pracovní toky ilustrované selektivitou při validaci a výpočtem kvantifikační chyby s použitím více interních standardů na lipidovou třídu. Výsledky validace potvrzují použitelnost obou metod, ale UHPSFC / MS poskytuje některé výrazné výhody, jako je úspěšná separace nepolárních a polárních lipidových tříd na rozdíl od HILIC-UHPLC / MS, kratší celkové doby běhu (8 vs. 10,5 min ) a mírně vyšší robustnost. Různé typy korelací mezi metodami (UHPSFC / MS a HILIC-UHPLC / MS), biologickým materiálem (plazma a sérum), IS (laboratorní a komerčně dostupné směsi) a literárními údaji o standardním referenčním materiálu ukazují intra- a mezilaboratorní srovnání v kvantifikaci lipidových druhů z osmi lipidových tříd, rozdíly v koncentraci v séru a plazmě, jakož i použitelnost nekomerčně dostupných směsí vnitřních standardů pro kvantifikaci lipidů. cze
dc.peerreviewed yes eng
dc.publicationstatus published version eng
dc.identifier.doi 10.1007/s00216-020-02473-3 eng
dc.relation.publisherversion https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/s00216-020-02473-3.pdf eng
dc.identifier.wos 000518160200002 eng
dc.identifier.obd 39884771 eng


Tento záznam se objevuje v následujících kolekcích

Zobrazit minimální záznam

Vyhledávání


Rozšířené hledání

Procházet

Můj účet