Průkaz genů kódujících vybrané faktory virulence u streptokoků se skupinovým antigenem G
Diplomová práceOtevřený přístupDatum publikování
2009
Autoři
Vedoucí práce
Oponent
Název časopisu
Název svazku
Vydavatel
Univerzita Pardubice
Abstrakt
Cílem diplomové práce byla optimalizace polymerázové řetězové reakce pro průkaz genů kódujících streptolyzin S, streptokokový pyrogenní exotoxin G a streptokokový mitogenní exotoxin Z u kmenů streptokoků se skupinovým antigenem G humánní a animální provenience. Zavedli jsme polymerázovou řetězovou reakci pro průkaz genu kódujícího streptolyzin S s využitím primerů sI a sII. Po úpravě koncentrace Mg2+ v reakční směsi na hodnotu 2,75 mmol/l a stanovení vhodné teploty annealingu (53 °C) jsme dosáhli detekčního limitu 28 pg. Dále jsme provedli optimalizaci polymerázové řetězové reakce pro průkaz genu kódujícího streptokokový pyrogenní exotoxin G s využitím primerů gI a gII. S reakční směsí obsahující 2,5 mmol/l Mg2+ a optimální teplotě annealingu (59 °C) jsme jako nejnižší možné detekovatelné množství DNA určili 300 pg. V neposlední řadě jsme optimalizovali polymerázovou řetězovou reakci pro průkaz genu kódujícího streptokokový mitogenní exotoxin Z s využitím primerů zI a zII. Po úpravě koncentrace Mg2+ v reakční směsi na 2,5 mmol/l a vhodné teplotě annealingu (55 °C) jsme jako nejnižší možné detekovatelné množství DNA určili 215 pg. Celkem jsme vyšetřili 190 lidských a 67 zvířecích kmenů streptokoků se skupinovým antigenem G. U všech testovaných kmenů streptokoků se skupinovým antigenem G humánní i animální provenience jsme prokázali gen kódující streptolyzin S. Žádný z lidských ani zvířecích kmenů neobsahoval gen kódující streptokokový pyrogenní exotoxin G a streptokokový mitogenní exotoxin Z.
Rozsah stran
72 s.
ISSN
Trvalý odkaz na tento záznam
Projekt
Zdrojový dokument
Vydavatelská verze
Přístup k e-verzi
Název akce
ISBN
Studijní obor
Analýza biologických materiálů
Studijní program
Speciální chemicko-biologické obory
Signatura tištěné verze
D20319
Umístění tištěné verze
Univerzitní knihovna (sklad)
Přístup k tištěné verzi
Klíčová slova
Polymerase Chain Reaction, group G streptococci, streptolysin S, streptococcal pyrogenic exotoxin G, streptococcal mitogenic exotoxin Z, Polymerázová řetězová reakce, streptokoky se skupinovým antigenem G, streptolyzin S, streptokokový pyrogenní exotoxin G, streptokokový mitogenní exotoxin Z