V bakalářské práci je popsán vnitřní kontrolní systém fungující v rámci Celní správy ČR. První část práce seznamuje s vývojem a historií celnictví na území našeho státu, s organizační strukturou Celní správy ČR a jejími úkoly. Další část práce přibližuje vnitřní kontrolu a interní audit prováděný ve veřejné správě. Závěrečná kapitola seznamuje s vnitřní kontrolní činností Celní správy ČR za rok 2006.