Proteomics analysis of aging proteins

Morvan, Marine

Publikace:
Proteomics analysis of aging proteins

Disertační práceopen access

dc.contributor.advisor	Česla, Petr (školitel)
dc.contributor.author	Morvan, Marine
dc.contributor.referee	Bednář, Petr
dc.contributor.referee	Kašička, Václav
dc.date.accepted	2023-10-26
dc.date.accessioned	2023-11-08T16:59:56Z
dc.date.available	2023-11-08T16:59:56Z
dc.date.issued	2023
dc.date.submitted	2023-09-20
dc.description.abstract	The analysis and characterization of aging and archaeological proteins are among the latest challenges in analytical chemistry. In the first part of this dissertation thesis, aging proteins were studied using LC-MS. The effects of aging on protein sequences, including amino acid racemization, post-translational modifications, and protein degradation, were studied. Subsequently, a chiral separation method was developer to determine the amino acid enantiomer rates. In the second part of this dissertation thesis, archaeological proteins were studied using nanoLC-MS. Proteomics, called paleoproteomics in this case, was developed as an alternative method for osteoarchaeology and genomics. Based on two sex-dependent forms of amelogenin protein preserved in teeth, both biological sexes were distinguished by nanoLC-MS because of differences in their protein sequences. The developed proteomic approach was designed to be minimally-invasive. This was confirmed by scanning the teeth before and after amelogenin extraction using both scanning electron microscope and micro-computer tomography.	eng
dc.description.abstract-translated	Analýza a charakterizace stárnutí a archeologických proteinů patří mezi nejnovější výzvy v analytické chemii. V první části této disertační práce byly studovány stárnoucí proteiny pomocí LC-MS. Byly studovány účinky stárnutí na proteinové sekvence, včetně racemizace aminokyselin, posttranslačních modifikací a degradace proteinů. Byla vyvinuta metoda chirální separace pro stanovení poměrů aminokyselinových enantiomerů. V druhé části práce byly archeologické proteiny studovány pomocí nanoLC-MS. Proteomika, v tomto případě zvaná paleoproteomika, byla vyvinuta jako alternativní metoda k osteoarcheologii a genomice. Na základě dvou forem proteinu amelogenin, který je pohlavně rozdílný, konzerovovaných v zubech, byly obě pohlaví rozlišeny metodou nanoLC-MS na základě rozdílů v sekvencích. Vyvinutý proteomický přístup byl navržen tak, aby byl minimálně invazivní. To bylo potvrzeno skenováním zubů před a po extrakci amelogeninu.	cze
dc.description.department	Fakulta chemicko-technologická	cze
dc.description.grade	Dokončená práce s úspěšnou obhajobou	cze
dc.identifier	Univerzitní knihovna (studovna)	cze
dc.identifier.signature	D40678
dc.identifier.stag	47407
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/10195/82416
dc.language.iso	eng
dc.publisher	Univerzita Pardubice	cze
dc.rights	bez omezení	cze
dc.subject	amelogenin	cze
dc.subject	aminokyseliny	cze
dc.subject	chirální separace	cze
dc.subject	degradace proteinů	cze
dc.subject	kolagen	cze
dc.subject	LC-MS	cze
dc.subject	paleoproteomika	cze
dc.subject	posttranslační modifikace	cze
dc.subject	proteomika stárnutí	cze
dc.subject	aging proteomics	eng
dc.subject	amelogenin	eng
dc.subject	amino acids	eng
dc.subject	chiral separation	eng
dc.subject	collagen	eng
dc.subject	LC-MS	eng
dc.subject	paleoproteomics	eng
dc.subject	post-translational modifications	eng
dc.subject	protein degradation	eng
dc.thesis.degree-discipline	Analytical Chemistry	cze
dc.thesis.degree-grantor	Univerzita Pardubice. Fakulta chemicko-technologická	cze
dc.thesis.degree-name	Ph.D.
dc.thesis.degree-program	Analytical Chemistry	cze
dc.title	Proteomics analysis of aging proteins	cze
dc.title.alternative	Proteomická analýza stárnoucích proteinů	eng
dc.type	disertační práce	cze
dspace.entity.type	Publication