Digitální knihovna UPCE přechází na novou verzi. Omluvte prosím případné komplikace. / The UPCE Digital Library is migrating to a new version. We apologize for any inconvenience.

Publikace:
Phenol/Chloroform-Free TiO2-Based miRNA Extraction from Cell Lysate

Článekopen accesspeer-reviewedpublished
Zobrazit minimální záznam
dc.contributor.authorSmělá, Denisa
dc.contributor.authorZelinková, Eliška
dc.contributor.authorŘehulka, Pavel
dc.contributor.authorBílková, Zuzana
dc.contributor.authorKupčík, Rudolf
dc.date.accessioned2023-07-12T12:59:38Z
dc.date.available2023-07-12T12:59:38Z
dc.date.issued2022
dc.description.abstractWhile microRNAs are considered as excellent biomarkers of various diseases, there are still several remaining challenges regarding their isolation. In this study, we aimed to design a novel RNA isolation method that would help to overcome those challenges. Therefore, we present a novel phenol/chloroform-free, low-cost method for miRNA extraction. Within this method, RNA is extracted from cell lysate with an isopropanol/water/NaCl system, followed by solid-phase extraction using TiO2 microspheres to effectively separate short RNAs from long RNA molecules. We also demonstrated the pH-dependent selectivity of TiO2 microspheres towards different sizes of RNA. We were able to regulate the size range of extracted RNAs with simple adjustments in binding conditions used during the solid-phase extraction.eng
dc.description.abstract-translatedAčkoliv jsou microRNA považovány za excelentní biomarkery pro řadu onemocnění, jejich izolace má stále řadu limitací. V této studii jsme se zaměřili na vývoj nové metody izolace RNA, která by některé z těchto limitů pomohla překonat. V této práce je uvedena nová, ekonomicky dostupná metoda izolace RNA, která nevyužívá systému fenol/chloroform. RNA je extrahována z buněčného lyzátu pomocí systému isopropanol/voda/NaCl, který je následován extrakcí na pevnou fázi s využitím TiO2 mikrosfér. Je zde také popsán vliv pH na selektivitu TiO2 mikrosfér k různým velikostem RNA molekul. Pomocí úpravy vazebných podmínek je možné regulovat, jaké rozmezí velikostí RNA molekul bude během extrakce na pevnou fázi ze vzorku izolováno.cze
dc.formatp. 8848eng
dc.identifier.doi10.3390/ijms23168848
dc.identifier.issn1661-6596
dc.identifier.obd39887629
dc.identifier.scopus2-s2.0-85137739076
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10195/81014
dc.identifier.wos000845731600001
dc.language.isoeng
dc.peerreviewedyeseng
dc.project.IDEF17_048/0007421/NANOBIO - posilování mezioborové spolupráce ve výzkumu nanomateriálů a při studiu jejich účinků na živé organismycze
dc.publicationstatuspublishedeng
dc.publisherMDPIeng
dc.relation.ispartofInternational Journal of Molecular Sciences, volume 23, issue: 16eng
dc.relation.publisherversionhttps://www.mdpi.com/1422-0067/23/16/8848
dc.rightsopen accesseng
dc.rights.licenceCC BY 4.0
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectmiRNA isolationeng
dc.subjectTiO2eng
dc.subjectphenol/chloroform-freeeng
dc.subjectshort RNA extractioneng
dc.subjectmiRNA izolacecze
dc.subjectTiO2cze
dc.subjectextrakce krátkých RNAcze
dc.titlePhenol/Chloroform-Free TiO2-Based miRNA Extraction from Cell Lysateeng
dc.title.alternativeExtrakce miRNA z buněčného lyzátu bez fenol/chloroformu s využitím nosiče na bázi TiO2cze
dc.typeArticleeng
dspace.entity.typePublication

Soubory

Původní svazek

Nyní se zobrazuje 1 - 1 z 1
Náhled
Název:
ijms-23-08848.pdf
Velikost:
1.16 MB
Formát:
Adobe Portable Document Format
ijms-23-08848.pdf (1.16 MB)

Kolekce

Publikační činnost akademických pracovníků UPCE / UPCE Research Outputs
Publikační činnost akademických pracovníků FChT / FChT Research Outputs