Optimalizace robotických syntéz peptidů na pevném nosiči v mikromolárním měřítku

Fesina, Ihor

Publikace:
Optimalizace robotických syntéz peptidů na pevném nosiči v mikromolárním měřítku

Diplomová práceopen access

dc.contributor.advisor	Váňa, Jiří
dc.contributor.author	Fesina, Ihor
dc.date.accepted	2022-06-07
dc.date.accessioned	2022-07-02T04:50:10Z
dc.date.available	2022-07-02T04:50:10Z
dc.date.issued	2022
dc.date.submitted	2022-05-09
dc.description.abstract	Diplomová práce se zabývá optimalizací podmínek robotických syntéz peptidů v mikromolárním měřítku pomocí automatického syntetizátoru MultiPep RSi. K nastavení parametrů robotického syntetizátoru byly využity 4 standardy oligopeptidů. Jako standardy byly syntetizovány a izolovány v čisté formě oligopeptidy: oxytocin, vazopresin, ACP a jeden peptid s ad hoc navrženou sekvencí. Standardy byly purifikovány pomocí preparativní HPLC, jejich čistota a chemická struktura byla analyzována pomocí RP-UPLC, HRMS a HPLC-MS analýzy. Syntézy testovacích peptidů byly provedeny na syntetizátorech Symphony a LibertyBlue. Následně bylo provedeno zkoumání řady parametrů robotického syntetizátoru pro syntézu 4 testovacích peptidů za různých procesních podmínek. Na základě získaných poznatků byl navržen optimalizovaný protokol syntézy. Pomocí optimalizovaného postupu byla provedena úspěšná ověřovací syntéza dvou delších peptidů sestávajících z 15 a 21 aminokyselin.	cze
dc.description.abstract-translated	This master's thesis deals with the optimization of robotic peptide synthesis conditions in micromolar scale using the automatic synthesizer MultiPep RSi. Four oligopeptide standards have been used to set the parameters of the robotic synthesizer. Oligopeptides: oxytocin, vasopresin, ACP, and one peptide with an ad hoc designed sequence have been synthesized and isolated in pure forms. The standards have been purified by preparative HPLC. Purity and chemical structure analysis were provided using RP-UPLC, HRMS and HPLC-MS analysis. Synthesis of the test peptides was performed using Symphony and LibertyBlue synthesizers. A number of robotic synthesizer parameters for the synthesis of the four test peptides under different process conditions have been investigated. Based on the acquired knowledge, an optimized synthesis protocol has been designed. Using an optimized procedure, a successful validation synthesis of two longer peptides consisting of 15 and 21 amino acids has been performed.	eng
dc.description.defence	Diplomant přednesl cca 15 min. přednášku na téma své diplomové práce s názvem "Optimalizace robotických syntéz peptidů na pevném nosiči v mikromolárním měřítku". Po přečtení posudku školitele a oponenta se diplomant vyjádřil k dotazům oponentského posudku. K obhajobě práce byly dále vzneseny následující dotazy: prof. Cibulka: Jaké jsou zdroje, kde se získávají výchozí látky? prof. Ludwig: Jaké jsou doby trvání syntéz na zmíněných přístrojích?	cze
dc.description.department	Fakulta chemicko-technologická	cze
dc.description.grade	Dokončená práce s úspěšnou obhajobou	cze
dc.format	88 s.
dc.identifier.stag	44053
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/10195/79600
dc.language.iso	cze
dc.publisher	Univerzita Pardubice	cze
dc.rights	Bez omezení
dc.subject	peptidy	cze
dc.subject	syntéza na pevné fázi	cze
dc.subject	SPPS	cze
dc.subject	robotická syntéza	cze
dc.subject	optimalizace procesů	cze
dc.subject	peptides	eng
dc.subject	solid phase peptide synthesis	eng
dc.subject	SPPS	eng
dc.subject	robotic synthesis	eng
dc.subject	process optimization	eng
dc.thesis.degree-discipline	Organická chemie	cze
dc.thesis.degree-grantor	Univerzita Pardubice. Fakulta chemicko-technologická	cze
dc.thesis.degree-name	Ing.
dc.thesis.degree-program	Chemie	cze
dc.title	Optimalizace robotických syntéz peptidů na pevném nosiči v mikromolárním měřítku	cze
dc.title.alternative	Optimization of robotic solid phase peptide synthesis in micromolar scale	eng
dc.type	diplomová práce	cze
dspace.entity.type	Publication