Co může prozradit profil mastných kyselin o bakteriích?

Hofmeisterová, Leona; Šilha, David; Kanďár, Roman

Digitální knihovna UPCE
→
Univerzita Pardubice
→
Publikační činnost akademických pracovníků UPCE / UPCE Research Outputs
→
Zobrazit záznam

dc.contributor.author	Hofmeisterová, Leona
dc.contributor.author	Šilha, David
dc.contributor.author	Kanďár, Roman
dc.date.accessioned	2023-07-12T13:02:27Z
dc.date.available	2023-07-12T13:02:27Z
dc.date.issued	2022
dc.identifier.issn	0009-0646
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/10195/81053
dc.description.abstract	Chemotaxonomické metody používané v bakteriální systematice pro zisk informací o chemickém složení bakteriálních buněk často využívají analytické postupy. Jednou z nejvíce využívaných metod je analýza mastných kyselin (MK), resp. metylesterů mastných kyselin (FAME, z angl. Fatty Acid Methyl Ester) plynovou chromatografií (GC). Význam této metody pro identifikaci bakterií je založen na strukturálních rozdílech MK jako je délka řetězce, přítomnost nasycených či nenasycených MK, výskyt rozvětvených MK, nebo přítomnost MK s OH skupinou. Spolehlivost a přesnost identifikace bakterií je dána dodržováním standardního operačního postupu při kultivaci bakteriálních buněk i GC analýze. Jedním z velmi dobře propracovaných komerčních systémů pro analýzu bakteriálních MK je Sherlock Microbial Identification Systém (MIS). Jedná se o automatizovaný systém GC, který umožňuje identifikaci celé řady mikroorganismů na základě detekce profilu FAME. Přítomnost různých MK a jejich relativní množství je porovnáno s profily MK referenčních kmenů. Analýza MK plynovou chromatografií je jednoduchou, ekonomicky nenáročnou, a především spolehlivou metodou identifikace.	cze
dc.format	p. 50-57	eng
dc.language.iso	cze
dc.relation.ispartof	Bulletin Československé společnosti mikrobiologické, volume 2, issue: Léto	eng
dc.rights	pouze v rámci univerzity	cze
dc.subject	GC	cze
dc.subject	identifikace	cze
dc.subject	mastné kyseliny	cze
dc.subject	GC	eng
dc.subject	identification	eng
dc.subject	fatty acids	eng
dc.title	Co může prozradit profil mastných kyselin o bakteriích?	cze
dc.title.alternative	What can the fatty acid profile reveal about bacteria?	eng
dc.type	article	eng
dc.description.abstract-translated	Chemotaxonomic methods used in bacterial systematics often use analytical procedures to obtain information about the chemical composition of bacterial cells. One of the most widely used methods is the analysis of fatty acids (FA) or fatty acid methyl esters (FAME) by gas chromatography (GC). The relevance of this method for the identification of bacteria is based on structural differences in FA such as chain length, the presence of saturated or unsaturated FA, the presence of branched FA, or the presence of FA with an OH group. The reliability and precision of bacterial identification is due to the adherence to standard operating procedures for both bacterial cell culture and GC analysis. One of the very sophisticated commercial systems for bacterial GC analysis is the Sherlock Microbial Identification System (MIS), an automated GC system that allows the identification of a wide range of microorganisms based on the detection of the FAME profile. The presence of different FA and their relative abundance is compared with the FA profiles of reference strains. Analysis of FA by gas chromatography is a simple, economically inexpensive, and, above all, reliable method of identification.	eng
dc.peerreviewed	yes	eng
dc.publicationstatus	postprint	eng
dc.project.ID	SGS_2022_004/Analytické, molekulárně biologické, mikrobiologické a cytologické metody pro laboratorní diagnostiku různých chorob a patologických stavů	cze
dc.identifier.obd	39887752